Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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