Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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