Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmem53Q9D0Z3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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