Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms