Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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