Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms