Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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