Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms