Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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