Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc8b1Q925Q3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms