Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd3Q91W18 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms