Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms