Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssh3Q8K330 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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