Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms