Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

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Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtmr3Q8K296 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtmr3Q8K296 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtmr3Q8K296 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtmr3Q8K296 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtmr3Q8K296 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mtmr3Q8K296 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mtmr3Q8K296 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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