Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nek9Q8K1R7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nek9Q8K1R7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nek9Q8K1R7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nek9Q8K1R7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms