Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms