Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf628Q8CJ78 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms