Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms