Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms