Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klhl11Q8CE33 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klhl11Q8CE33 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms