Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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