Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms