Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SynpoQ8CC35 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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