Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms