Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ9

Slu7, Pre-mRNA-splicing factor SLU7, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slu7Q8BHJ9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slu7Q8BHJ9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slu7Q8BHJ9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slu7Q8BHJ9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slu7Q8BHJ9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slu7Q8BHJ9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slu7Q8BHJ9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms