Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms