Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CdsnQ7TPC1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CdsnQ7TPC1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms