Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Eci3Q78JN3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Eci3Q78JN3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Eci3Q78JN3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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