Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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