Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim37Q6PCX9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim37Q6PCX9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim37Q6PCX9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trim37Q6PCX9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim37Q6PCX9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trim37Q6PCX9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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