Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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