Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms