Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prkd1Q62101 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms