Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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