Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sim1Q61045 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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