Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ncor1Q60974 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ncor1Q60974 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms