Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NacadQ5SWP3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NacadQ5SWP3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NacadQ5SWP3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NacadQ5SWP3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NacadQ5SWP3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms