Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms