Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms