Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc34Q3UI66 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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