Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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