Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt1Q3TX08 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms