Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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