Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms