Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms