Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Perm1Q149B8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Perm1Q149B8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms