Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MestQ07646 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms