Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gdf3Q07104 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gdf3Q07104 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms