Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb5Q02739 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms